Video: Kā kontigi tiek samontēti sastatnēs?
2024 Autors: Miles Stephen | [email protected]. Pēdējoreiz modificēts: 2023-12-15 23:38
Veidojot genoma melnrakstu, vispirms tiek veikti atsevišķi DNS nolasījumi salikti kontigos , kas pēc būtības to montāža , starp tām ir atstarpes. Nākamais solis ir uz tad izlīdziniet plaisas starp tām kontigs uz izveidot a sastatnes . To var izdarīt, izmantojot optisko kartēšanu vai mate-pair sekvencēšanu.
Tāpat jūs varat jautāt, kas ir kontigi un sastatnes?
A sastatnes ir genoma sekvences daļa, kas rekonstruēta no gala sekvencētiem visa genoma bises kloniem. Sastatnes sastāv no kontigiem un spraugas. A kontig ir blakus esošais genoma secības garums, kurā bāzu secība ir zināma ar augstu ticamības līmeni. Dažos gadījumos, sastatnes var pārklāties.
Turklāt, kas ir kontigs bioinformātikā? A contig (no blakus esošajiem) ir DNS segmentu kopums, kas pārklājas, kas kopā veido DNS vienprātīgu reģionu. Contigs tādējādi var attiekties gan uz DNS secību, kas pārklājas, gan uz pārklājošiem fiziskajiem segmentiem (fragmentiem), kas ietverti klonos atkarībā no konteksta.
Šajā sakarā, kā tiek samontēti kontigi?
DNS fragmentu pārklājošās DNS sekvences kopa ir pazīstama kā a kontig . Contig kartēšana ir process, kurā kloni pārklājas samontēts lai secinātu šo pārklājumu. Tas ietver sakārtošanu kontigiem kārtībā un orientācijā. Klonēt kontigiem var būt automātiski samontēts izmantojot to BAC beigu sekvences.
Kāpēc kontigi ir svarīgi?
Contig montāža ir svarīgs solis genoma montāžā. Kartēšanai tiek apkopoti pārklājošie kloni, lai secinātu, ka tie pārklājas. Katrs fragments tiek klonēts vektorā un sekvencēts no abiem galiem, lai iegūtu sekvences garumu aptuveni 600–700 bp. Sekvenci no abiem DNS fragmenta galiem sauc par pāra galu.
Ieteicams:
Kā tiek sakārtoti nogulumieži?
Nogulumiežu iežus var iedalīt divās kategorijās. Pirmais ir detritāls iezis, kas rodas iežu fragmentu, nogulumu vai citu materiālu erozijas un uzkrāšanās rezultātā, kas kopumā tiek klasificēti kā detrīts vai atlūzas. Otrs ir ķīmiskais iezis, kas iegūts, izšķīdinot un nogulsnējot minerālus
Kāda veida grafiks tiek izmantots kārtas datiem?
Statistikā pamatnoteikumi ir šādi: Nominālajiem/kārtas mainīgajiem izmantojiet sektoru diagrammas un joslu diagrammas. Intervālu/attiecību mainīgajiem izmantojiet histogrammas (vienādu intervālu joslu diagrammas)
Kura organella tiek uzskatīta par rūpnīcu, jo tā tiek uzņemta neapstrādātā veidā?
Hloroplasti pārvērš saules gaismu, oglekļa dioksīdu un ūdeni pārtikā (glikozē). Kura organella tiek uzskatīta par “rūpnīcu”, jo tā uzņem izejvielas un pārvērš tās par šūnu produktiem, ko šūna var izmantot? Šūnu membrāna aizsargā šūnu; kontrolē to, kas notiek šūnā un no tās, komunikāciju
Ko bioloģijā nozīmē sastatnes?
Atjaunināts 2015. gada 8. janvārī. Sastatnes kopumā nozīmē struktūru, kas nodrošina atbalstu. Labākais sastatņu piemērs bioloģijā ir lauzta kaula (lūzuma) labošana. Sākotnējo pagaidu struktūru veido ķermenis, ko sauc par pro callus. Uz to notiek turpmāka izaugsme
Kāpēc nātrija kālija sūknis tiek uzskatīts par aktīvu transportu, kurā virzienā tiek sūknēts nātrijs un kālijs?
Nātrija-kālija sūknis. Aktīvais transports ir enerģiju prasošs process, kurā molekulas un joni tiek sūknēti cauri membrānām “augšup” pret koncentrācijas gradientu. Lai pārvietotu šīs molekulas pret to koncentrācijas gradientu, ir nepieciešams nesējproteīns