Kā tiek aprēķināts izlīdzināšanas rezultāts?
Kā tiek aprēķināts izlīdzināšanas rezultāts?

Video: Kā tiek aprēķināts izlīdzināšanas rezultāts?

Video: Kā tiek aprēķināts izlīdzināšanas rezultāts?
Video: Kā Latvijas sporta sistēmā tiek izmantots augstskolu resurss? 2024, Decembris
Anonim

The rezultāts no an izlīdzināšana , S, aprēķināts kā aizstāšanas un starpības summu punktu skaitu . Aizstāšana punktu skaitu tiek doti ar uzmeklēšanas tabulu (sk. PAM, BLOSUM). Plaisa punktu skaitu parasti ir aprēķināts kā G, spraugas atvēršanas soda un L, starpības pagarināšanas soda summa. Atstarpei, kuras garums ir n, atstarpes izmaksas būtu G+Ln.

Tātad, kas ir izlīdzināšanas rādītājs?

Optimāli izlīdzināšana un izlīdzināšanas rezultāts Optimāls izlīdzināšana ir izlīdzināšana dodot augstāko rezultāts , un izlīdzināšanas rezultāts ir šis augstākais rezultāts . Tas ir, izlīdzināšanas rezultāts no X un Y = rezultāts X un Y zem optimālā izlīdzināšana . Piemēram, izlīdzināšanas rezultāts no šiem X un Y ir 36.

Papildus iepriekš minētajam, kā darbojas secību izlīdzināšana? Bioinformātikā a secības izlīdzināšana ir veids, kā sakārtot sekvences DNS, RNS vai proteīna, lai identificētu līdzības reģionus, kas var būt funkcionālu, strukturālu vai evolucionāru attiecību starp sekvences.

Kas ir rezultāts bioinformātikā?

Secību izlīdzināšanas kontekstā a rezultāts ir skaitliska vērtība, kas raksturo izlīdzinājuma vispārējo kvalitāti. Lielāki skaitļi atbilst lielākai līdzībai. The rezultāts mērogs ir atkarīgs no punktu gūšana izmantotā sistēma (aizvietošanas matrica, nepilnības sods).

Kas ir optimālā secības izlīdzināšana?

The optimāla izlīdzināšana no diviem proteīniem sekvences ir izlīdzināšana kas palielina pāru rezultātu summu, no kuras atņemts sods par ieviestajām nepilnībām. Dinamiskā programmēšana ļauj optimāla izlīdzināšana no diviem sekvences jāatrod mnsoļu secībā, kur m un n ir garumi sekvences.

Ieteicams: